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Genetische Rohdaten: Was ist das, was enthalten sie und wie lädt man sie bei Koko Genetics herunter?

Was sind die Raw Data von Koko Genetics? Entdecken Sie, was die unverarbeitete DNA-Datei Ihres Haustieres enthält, wozu sie dient und wie Sie sie noch heute kostenlos herunterladen können.

Wenn Sie die Ergebnisse von Koko Genetics erhalten, sehen Sie einen schönen, leicht verständlichen Bericht voller Wissenswertem über die Rasse, die Merkmale und die Gesundheit Ihrer Fellnase. Aber wussten Sie, dass hinter diesem Bericht eine riesige Datenbank steckt?

Bei Koko Genetics glauben wir, dass die genetischen Informationen Ihres Haustieres Ihnen gehören. Deshalb stellen wir Ihnen die Raw Data (Rohdaten) zur Verfügung: die ursprüngliche und unverarbeitete Datei, die direkt aus unserem Labor kommt.

Was genau sind genetische Raw Data?

Die Raw Data für Hunde und Katzen sind eine digitale Datei, die die vollständige Auslesung der Genotypisierung Ihres Haustieres enthält. Stellen Sie es sich wie das „Negativ“ eines Fotos oder die rohen Zutaten vor, bevor das fertige Gericht gekocht wird.

Diese Datei enthält Informationen zu allen genetischen Markern, die auf dem Chip (Array) vorhanden sind, den wir im Labor verwenden, nicht nur zu denen, die in Ihrem Ergebnisbericht erscheinen. Wir sprechen von einer massiven Auslesung von Nukleotiden (den Buchstaben der DNA), genau so, wie sie von unserer Technologie erkannt werden. Da es sich um „rohe“ Daten handelt, haben sie nicht den spezifischen Interpretationsfilter oder die Qualitätskontrolle durchlaufen, die wir anwenden, um die Gesundheits- und Merkmalsberichte zu erstellen. Es handelt sich um rein technische Informationen.

Welche Informationen enthält diese Datei?

Wenn Sie Ihre Raw Data herunterladen, erhalten Sie eine Datei im .csv-Format (aufgrund ihrer Größe in einer .zip-Datei komprimiert) mit mehr Zehntausende von Markern. Jede Zeile repräsentiert einen spezifischen Punkt im Genom Ihres Haustieres. Damit Sie diese wie ein Experte interpretieren können, finden Sie hier eine Anleitung zum Verständnis der Spalten Ihrer Datei:

  • ID (Probe ID): Dies ist die Kennung der Sonde auf unserem Chip (Axiom Koko Array). Es ist sozusagen der „technische Name“ dieses Markers.
  • Chromosom: Gibt an, wo diese genetische Variante liegt.
  • Position: Der genaue Ort innerhalb des Chromosoms, an dem sich der Marker befindet. Hierfür verwenden wir als Referenzgenom CanFam 3.1 (der aktuelle wissenschaftliche Standard) für Hunde und Felis catus_9.0 für Katzen.
  • Genotyp: Hier liegt der „Kern“ der Sache. Sie sehen Kombinationen aus zwei Buchstaben (Allelen), die A, T, G, C sein können. Wenn Sie ein I oder ein D sehen, beziehen diese sich auf Insertionen oder Deletionen.
  • Wenn ein Bindestrich (–) erscheint, bedeutet dies, dass der Genotyp für diesen spezifischen Marker nicht bestimmt werden konnte.

Wozu dient es, die Raw Data zu haben?

Vielleicht fragen Sie sich: „Wenn ich schon meinen schönen Bericht habe, wozu brauche ich dann eine riesige Tabellenkalkulation?“. Hier sind drei Gründe:

  1. Volle Transparenz: Sie haben Zugriff auf dieselben Basisinformationen wie wir.
  2. Eigene Recherche: Wenn Sie ein fortgeschrittener Benutzer oder Tierarzt sind, können Sie nach spezifischen Varianten suchen, die für Sie von Interesse sind.
  3. Kompatibilität: Zum heutigen Stand gibt es keine anderen Unternehmen oder externen Plattformen, die das Hochladen und Verarbeiten von Raw Data-Dateien von Hunden oder Katzen ermöglichen. Angesichts des Tempos, mit dem sich der Sektor entwickelt, ist es jedoch möglich, dass sich das Panorama ändert und in Zukunft neue Möglichkeiten entstehen. Daher bereiten wir uns bei Koko Genetics darauf vor, uns an diesen großen Sprung anzupassen.

Schritt für Schritt: So laden Sie die Raw Data Ihres Haustieres herunter

Diese Datei zu erhalten ist sehr einfach und für Benutzer von Koko Genetics völlig kostenlos. Folgen Sie einfach diesen Schritten:

  1. Loggen Sie sich in Ihr Koko Genetics-Konto ein.
  2. Gehen Sie in Ihren Privatbereich.
  3. Klicken Sie auf den Abschnitt Einstellungen.
  4. Wählen Sie die Option Raw Data.
  5. Automatisch wird eine .zip-Datei generiert und heruntergeladen. Sie müssen sie nur auf Ihrem Computer entpacken, um auf die .csv- oder .txt-Datei zuzugreifen und die Daten anzuzeigen.

Um Zugriff auf diesen Detaillierungsgrad (und Ihre Raw Data-Datei) zu haben, müssen Sie zunächst Ihren besten Freund genotypisieren. Unser DNA-Test für Hunde und Katzen ist das Tor zu seiner Biologie.